南红玛瑙与红珊瑚都有着相同或相似的颜色，在产状上是很好区分的，南红玛瑙是块状，红珊瑚是树枝状，但是成品，特别是颜色都是相似的红色的成品就比较难以区分。但是只要掌握了它们各自的特点，还是能发现它们的不同的。
一、块度不同
因为南红的产状通常为不规则的块状，相对红珊瑚来说块度较大，所以可以做到更大的珠子和雕件。当然，也会有小件的南红，这只是一个排除法。
二、光泽不同
红珊瑚属于有机宝石，表面的光泽偏向于温润的宝石光泽，或者是玻璃光泽。而南红属于玉石，光泽更偏向与蜡状光泽。
三、纹理不同
南红玛瑙的纹理是比较明显典型的条带状玛瑙纹，高品质的南红是看不到的。而红珊瑚的纹理虽然因为品种不同，有些肉眼可见，有些肉眼不可见，但在放大镜下，都可以观察到平行分布的细密的纹理，纵向是波状，横截面有同心圆和放射状，一般珠子和戒面是指纹状的。
四、硬度不同
硬度由于南红玛瑙与红珊瑚的组成成分不同，硬度上的差异也很明显。南红玛瑙硬度在摩氏7左右，而红珊瑚只有摩氏4左右，所以从硬度方面很容易将两者区分开来。
五、瑕疵不同
红珊瑚因为是珊瑚虫的骨骼，而且生活在深海，难免会有白芯、虫眼等，而南红玛瑙不可能有白芯和虫眼。
六、手感不同
红珊瑚的手感跟蜜蜡差不多，是比较温润的，因为属于有机宝石。而南红是玉石，手感是比较比较凉。
七、价格不同
红珊瑚因为存量低，国家政策限制，采捞难度大等多方面原因，价格比南红要贵，平均克价在五六百左右，而南红的平均克价在两三百左右。不过沙丁红珊瑚的价格个南红玛瑙的价格差不多，有时候还比南红玛瑙价格便宜，还是需要综合前面的特点来区别。
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